Keliakialiitolla on parhaillaan menossa kaksi Raha-automaattiyhdistyksen rahoittamaa projektia.

Verkkoviestinnän ja sähköisten palveluiden kehittämisprojektissa luodaan liitolle uudet verkkosivut keskustelufoorumeineen, uusitaan jäsenrekisteri ja kehitetään taloushallinnon toimintoja.

Keliakiapotilaiden ruokavaliohoidon ohjauksen saatavuutta ja laatua kehitetään kolmevuotisessa ROKE-projektissa, joka käynnistyi vuonna 2009.

Lisäksi Keliakialiitto on yhteistyökumppanina mukana Diagnosoidun keliakian vaikuttavuustutkimuksessa, jota johtaa Tampereen yliopiston keliakiatutkimusryhmä sekä Pirkanmaan Astma- ja allergiayhdistyksen hallinnoimassa AATU-projektissa, jossa luotiin Erimenu-verkkopalvelu.